วิทยาลัยพระธรรมทูต มจร จัดโครงการทุนการศึกษาวิทยาลัยพระธรรมทูต ส่งพระธรรมทูตเรียนปริญญาโท มจร (Full Scholarship) จำนวน ๕ ทุน ๆ ละ ๑๐๐,๐๐๐ บาท (หนึ่งแสนบาทถ้วน) รวมเป็นเงิน จำนวน ๕๐๐,๐๐๐ บาท (ห้าแสนบาทถ้วน)
คุณสมบัติผู้ได้รับทุนการศึกษาระดับปริญญาโท ดังนี้คือ (๑) เป็นพระภิกษุ – สามเณร (๒) สำเร็จการศึกษาปริญญาตรี ไม่จำกัดสาขา เกรดเฉลี่ยสะสมไม่ต่ำกว่า ๒.๐๐ หรือ สำเร็จการศึกษาเปรียญธรรม ๙ ประโยค (๓) มีมนุษยสัมพันธ์และจิตอาสาทำงานอุทิศตนเผยแผ่พระพุทธศาสนา ด้วยความเสียสละ (๔) มีเกียรติประวัติดีงาม และมีสมณวัตรปฏิปทา ศีลาจริยวัตร เป็นที่ศรัทธาเลื่อมใส และ(๕) มีทักษะการสื่อสารภาษาอังกฤษที่สามารถใช้งานได้ดี
สำหรับพระภิกษุสามเณรที่ประสงค์เข้าศึกษาในหลักสูตรปริญญาโท มหาวิทยาลัยมหาจุฬาลงกรณราชวิทยาลัย ทุกสาขาวิชา สามารถสมัครสอบชิงทุนการศึกษาวิทยาลัยพระธรรมทูต ได้
พระภิกษุสามเณรที่ได้รับทุนการศึกษาจากวิทยาลัยพระธรรมทูต มีข้อกำหนดให้ฝึกงานเป็นพระธรรมทูตสายต่างประเทศ จิตอาสา ณ วิทยาลัยพระธรรมทูต ตามที่วิทยาลัยพระธรรมทูตกำหนด อาทิ จิตอาสาต้อนรับอาคันตุกะต่างประเทศ จิตอาสาช่วยงานโครงการอบรมพระธรรมทูตสายต่างประเทศ จิตอาสาช่วยโครงการหลักสูตรประกาศนียบัตรพระธรรมทูต ฯ
